Instytut Biologii

Tematyka: Celem pracy doktorskiej jest uwrażliwienie opornych komórek nowotworowych (rak piersi) na promieniowanie neutronowe za pomocą metody BNCT (ang. Boron-Neutron Capture Therapy). BNCT jest alternatywną metodą leczenia do standardowej radioterapii, jednak jej zastosowanie ogranicza toksyczne działanie związków boru na komórki prawidłowe. W celu uwrażliwienia komórek nowotworowych będą analizowane nanocząstki złota oraz związek boru (BSH lub BPA). Badania te maja na celu optymalizację działania metody BNCT oraz jej potencjalne zastosowanie w leczenia innego rodzaju nowotworu niż glejak wielopostaciowy.

Tematyka: Kluczową barierą w dostarczeniu rekombinowanych endolizyn fagowych w celu eradykacji bakterii Gram-ujemnych jest zewnętrzna błona komórkowa. Celem pracy jest opracowanie metody transportu endolizyn fagowych jako białek bakteriobójczej wobec P. aeruginosa. Badania obejmują naturalny proces permeabilizacji błony bakteryjnej zwany pyroptozą. Pyroptoza jest procesem odpowiedzi immunologicznej komórek eukariotycznych na infekcję bakterii Gram-ujemnych na drodze zależnej od lipopolisacharydu prowadzącej do perforacji błony komórkowej i uwolnienia czynników prozapalnych. Uważa się, że jedno z białek pyroptozy gasdermina D może również permeabilizować bakteryjną błonę zewnętrzną, co umożliwiłoby dostęp rekombinowanej endolizyny fagowej do przestrzeni periplazmatycznej, degradację petydoglikanu i śmierć komórki bakteryjnej. Dodatkowo badania obejmują również indukowanie procesu pyroptozy przez dendrytyczne nanocząstki złota, zdolne do destabilizacji błony komórkowej oraz aktywacji inflammasomu. Badania realizowane są w ramach projektu Narodowego Centrum Nauki OPUS nr. UMO-2017/27/B/NZ6/00199.

Tematyka: Escherichia coli należy do jednego z najbardziej adaptacyjnych gatunków, mogących przetrwać w różnych i niesprzyjających warunkach środowiskowych. Uropatogenne szczepy Escherichia coli (UPEC), które zwykle identyfikowano jako szczepy izolowane z moczu, obecnie są definiowane jako patogen wewnątrzkomórkowy. UPEC są bakteriami mogącymi tworzyć specyficzny biofilm tj. wewnątrzkomórkowe zbiorowiska bakteryjne (IBC, ang. Intracellular Bacterial Communities) wewnątrz powierzchownych komórek nabłonka dróg moczowych. Celem pracy jest określenie roli jaką pełnią UPEC tworzące IBC w patomechanizmie raka pęcherza moczowego.

Tematyka: Moja praca doktorska dotyczy zagadnienia jakim jest wpływ różnych czynników na promieniowrażliwość komórek U2OS. Analizowane przeze mnie czynniki to temperatura oraz niska moc dawki promieniowania jonizującego. Swoją pracę badawczą rozpoczęłam od analizy wpływu hipotermii na kinetykę powstawania ognisk naprawczych foci i mikrojąder w komórkach U2OS-53BP1 i U2OS-NBS1. Drugim analizowanym przeze mnie czynnikiem jest bardzo niska moc dawki promieniowania jonizującego. Ludzie stale narażeni są na niskie dawki czynników genotoksycznych (chemicznych i fizycznych) ze względu na ich obecność lub zanieczyszczenia środowiska czy aktywność zawodową. Adaptacja organizmu na niskie dawki promieniowania jonizującego to ciągle kwestia dyskusyjna. Narażenie na promieniowanie dotyczy ludzi zamieszkujących takie rejony świata, w których naturalne tło promieniowania jest podwyższone. Za pomocą modelu in vitro planuję zbadać wpływ bardzo małych dawek promieniowania jonizującego. W tym celu skonstruowano specjalne źródło ze zmielonej skały euksenitowej występującej w naturze. Trzecim etapem moich badań jest zbadanie kinetyki formowania ognisk naprawczych foci w jądrach i mikrojądrach w komórkach U2OS-53BP1. Celem zaplanowanych badań jest analiza indukcji i naprawy podwójnoniciowych pęknięć DNA, obserwowanych jako ogniska 53BP1 w jądrach i mikrojądrach komórek U2OS.

Tematyka: Celem pracy doktorskiej jest optymalizacji techniki interferometrii laserowej do zastosowań biomedycznych. W badaniach zostanie wykorzystany nowy układ pomiarowy, tj. interferometr laserowy dedykowany do badań biologicznych. Optymalizacja techniki zostanie przeprowadzona w trzech układach modelowych. Pierwszy z nich to charakterystyka uwalniania lizozymu i fukonazolu z hydroksyapatytu, jako potencjalnego wypełnienia kostnego dedykowanego do zastosowań w medycynie. Drugim etapem badań jest analiza dyfuzji substancji biologicznie czynnych oraz nośników leków przez monowarstwę komórek eukariotycznych CHO-K1. Planuje się charakterystykę dyfuzji dendrymerów jako nośników substancji biologicznie czynnych oraz wybranych tiocukrów. W ostatnim etapie pracy analizowana będzie szeroko aktywność przeciwbakteryjna opatrunków żelowych zawierające bakteriofagi wobec P. aeruginosa PAO1. Część badań realizowana jest w ramach projektu Narodowego Centrum Nauki OPUS nr. UMO- 2016/21/B/NZ6/01157.

Tematyka: Wpływ suplementów diety o zróżnicowanej zawartości kwasów tłuszczowych na morfologię hepatocytów i markery stresu oksydacyjnego w wybranych tkankach myszy. Tłuszczowe suplementy diety są grupą powszechnie stosowanych preparatów, wzbogacających codzienną dietę o niezbędne nienasycone kwasy tłuszczowe, konieczne do zapewnienia prawidłowego funkcjonowania organizmu człowieka. W ostatniej dekadzie zaobserwowano nadmierne zainteresowanie suplementami diety. Brak wymagań badań klinicznych dla suplementów ogranicza wiedzę w zakresie zarówno farmakokinetyki substancji wchodzących w skład tych produktów, jak i interakcji z innymi ksenobiotykami oraz ich działań niepożądanych. Praca obejmuje wyniki oddziaływania wybranych suplementów diety o zróżnicowanej zawartości kwasów tłuszczowych na morfologię hepatocytów i markery stresu oksydacyjnego w wybranych tkankach myszy.

Tematyka: Problematyka badawcza rozprawy doktorskiej dotyczy opracowania złoża polimerowego na bazie chitozanu do oczyszczania produktów białkowych z endotoksyny bakteryjnej (lipopolisacharyd; LPS). W pierwszym etapie badań opracowane zostaną różne formy użytkowe chitozanu. Przewiduje się wytworzenie złóż chitozanowych, które zostaną poddane ocenie parametrów fizycznych, chemicznych, mechanicznych oraz termicznych. W drugim etapie badań, jako układy modelowe do testowania opracowanych złóż zostaną zastosowane dwa enzymy: lizozym oraz rekombinowana endolizyna fagowa pochodząca z procesu biotechnologicznego przed etapem oczyszczania z endotoksyny. Opracowane złoże zostanie porównane pod kątem wydajności z komercyjnymi rozwiązaniami.

Tematyka: Celem pracy jest charakterystyka mechanizmu permeabilizacji zewnętrznej błony bakteryjnej (OM) przez kationowe dendrytyczne nanocząstki, takie jak nanocząstki złota, nanocząstki srebra, dendrymery poliamidoaminowe PAMAM oraz dendrymery karbokrzemowodorowe. Mechanizm permeabilizacji błony będzie badany przy pomocy liposomów, jako modelu zewnętrznej błony bakteryjnej (OM). Dodatkowo mechanizm ten będzie badany również na antybiotykoodpornych szczepach bakterii Pseudomonas. Zbadanie wyżej wymienionego efektu da odpowiedz na pytanie czy permeabilizacji zewnętrznej błony bakteryjnej przez kationowe nanocząstki pozwoli na transport białek antybakteryjnych degradujących peptydoglikan (PG). Wyniki tych badań przyczynią się do opracowania nowych alternatyw do walki z opornością antybiotykową bakterii lekoopornych.

Tematyka: Tematyka moich badań dotyczy zastosowania techniki sekwencjonowania następnej generacji (Next Generation Sequencing, NGS) w badaniach minimalnej choroby resztkowej (Minimal Resiual Desease, MRD) w przebiegu ostrej białaczki szpikowej. MRD charakteryzuje się obecnością niewielkiej liczby komórek nowotworowych (w czasie remisji lub leczenia), co prowadzi do częstych nawrotów. Stan ten jest trudny do diagnostyki z wykorzystaniem standardowych metod, natomiast zastosowanie NGS pozwala na detekcję zmian z wysoką czułością. Prowadzone przeze mnie badania mają na celu pełne zrozumienie znaczenia zmian genetycznych (mutacje oraz zmienność poziomu ekspresji) związanych z omawianą jednostką chorobową. Przyczynić się to może do powstawania nowoczesnych i spersonalizowanych metod terapeutycznych oraz ułatwi diagnostykę i monitorowanie MRD.